Après s'être injecté de la promicine, Danny, le frère de Shawn, répand la mort sur son passage. Seattle est bientôt menacée de pandémie. Tom a survécu à la blessure mortelle infligée par Diana et oeuvre maintenant pour infiltrer les rangs des marqués et anéantir leur plan d'invasion. Il faut aussi arrêter Isabelle, envoyée pour tuer Jordan Collier. De son côté, Meghan, dernière autorité du NTAC, négocie avec Kyle, responsable de la Cité Promise, de sécuriser la ville qui échappe à tout contrôle... Les 4400 réussiront-ils à sauver le monde ?